受洪灾影响，余干境内江河湖库水位猛涨，导致渔业养殖基地池坝、围栏、网片大面积受淹损毁，渔业受灾面积6.1万亩，鱼种、成鱼外流及基础设施损毁等直接经济损失巨大。为帮助养殖户重建信心，当地政府及水产部门出台各种优惠政策，鼓励受灾养殖户积极生产自救。县水产部门组织了6支抢险救灾小分队，深入到重点渔业生产区，核查灾情，组织渔民回捕逃逸的鱼蟹，对未达到商品规格的水产品进行就近收购、暂养，待洪水退去后进行回放。同时对被洪水冲毁的鱼塘决口进行及时封堵，对破损的网箱、围拦网等渔业生产设施进行修复。

为保证灾后渔民收益不减，水产部门及时调运四大家鱼苗种，分派到各渔业养殖企业及渔业养殖户手中，采取补放的方法恢复生产。同时，紧急调配了一批鱼药等物资，实地讲解饲料投放安全用药知识，帮助渔民及时调节水质，预防灾后暴发性鱼病，确保渔业灾后不减产。