【生物资源】境内森林植被类型多样,种类丰富,主要植被类型有常绿阔叶林、针叶林、针阔混交林、常绿与落叶混交、阔叶林、灌木林。在现有植被中,主要生态树种有杉木、马尾松、湿地松、木荷、枫香、毛竹、拟赤杨、若槠、栲树等;生态经济兼用树种有杜仲等;经济树种有梨、柚、桃类、柑橘、脐橙和板栗等。林地面积53594公顷,占土地总面积的23%,森林覆盖率为20.9%,林木绿化率30.1%,其中有林地面积为48235.6公顷,疏林面积308.2公顷,灌木林面积1851.9公顷,未成林地1332.5公顷,无立木林地1003.7公顷,宜林地862.1公顷。全县活立木总蓄积1824703立方米,其中有林地蓄积1712423立方米,疏林地蓄积4427立方米,四旁树蓄积107853立方米。
余干县野生动物种类繁多,主要种类有鸟类、鱼类、爬行类、哺乳类。鸟类资源有15目45科205种,其中国家Ⅰ级保护有东方白鹳、黑鹳、白头鹤和白鹤等4种,国家Ⅱ级保护有白琵鹭、黑脸琵鹭、白额雁、小天鹅、黑翅鸢、苍鹰、普通鵟、白尾鹞、白头鹞、白腹鹞、鹊鹞、游隼、红脚隼、红隼、灰鹤、白枕鹤、花田鸡、小鸦鹃、褐翅鸦鹃、长耳鸮、短耳鸮、领角鸮、斑头鸺鹠、草鸮等24种,江西省保护鸟类白鹭、灰雁、野鸡、凤头潜鸭、豆雁、鸿雁等。蛇类眼镜蛇、王锦蛇、银环蛇、蝮蛇、菜花蛇等。国家II级保护野生动物还有穿山甲、髦羚、虎纹蛙、獐等,江西省重点保护的野生动物有黄鼠鼬、狐、金环蛇、银环蛇、眼镜蛇、野鸭、雁等共20多种。